1945年12月,縣商會(huì)集資(約計(jì)20擔(dān)糧食的錢),在縣直機(jī)關(guān)駐地陳莊創(chuàng)辦墾利縣農(nóng)民醫(yī)療診所。1948年初,利用原“仁和堂”私營藥鋪的房屋,將農(nóng)民醫(yī)療診所擴(kuò)建為農(nóng)民醫(yī)院(亦說“公民醫(yī)院”)。1950年夏,更名為墾利縣衛(wèi)生院。1962年8月起,開始籌建墾利縣人民醫(yī)院。1962年10月1日,墾利縣衛(wèi)生院改稱為墾利縣人民醫(yī)院。2016年8月2日,撤銷墾利縣,設(shè)立東營市墾利區(qū)。后更名為墾利區(qū)人民醫(yī)院。2019年4月8日,更名為東營市第五人民醫(yī)院?,F(xiàn)位于墾利區(qū)新興路99號(hào)。
2012年,被確立為全國第一批311所縣級(jí)公立醫(yī)院改革試點(diǎn)醫(yī)院之一;2013年,被國家衛(wèi)生計(jì)生委授予“基層醫(yī)院慢性疾病管理標(biāo)準(zhǔn)宣貫基地”稱號(hào);2015年,被確定為全國500家縣級(jí)公立醫(yī)院改革重點(diǎn)扶持醫(yī)院,在全省縣級(jí)公立醫(yī)院改革考核評(píng)比中取得全省第九名的成績; 2015年5月,醫(yī)院成為醫(yī)療機(jī)構(gòu)消毒與感染控制國家級(jí)監(jiān)測(cè)點(diǎn);2015年11月,被確定為全國早期胃癌篩查項(xiàng)目單位; 2018年1月,被授予“全省衛(wèi)生計(jì)生系統(tǒng)先進(jìn)集體”; 2020年12月,被授予“東營市抗擊新冠肺炎疫情先進(jìn)集體”。